第三次整體運輸研究是香港特別行政區政府進行同類研究的第三次，以便制訂一套適用至21世紀的均衡運輸計劃。早前同類研究分別於一九七三年及一九八六年進行。
本研究的目標，是為香港特別行政區政府提供綱領，以便制訂一套適用至二零一六年的均衡運輸策略，配合可持續環境發展的需要，促進香港的客貨運輸流通。本研究根據不同的土地用途及社會經濟發展假設情況以預測交通需求，建議擴展鐵路及道路系統，同時列出總值逾二千餘億元道路建設工程計劃的時間表，以滿足香港將來客貨運輸流通需求。本研究亦進行了策略性環境評估，衡量不同運輸發展及土地用途方案對環境的利弊。
本研究在交運輸政策及規劃方面採用以下指導性原則，為前運輸局在一九九九年所頒布運輸策略 「邁步前進:香港長遠運輸策略」制定基礎。
- 土地用途、運輸及環境的綜合規劃；
- 優先發展鐵路運輸；
- 協調並加強公共交通服務；
- 適時提供運輸基礎設施；
- 運用新科技管理交通；
- 更充份考慮行人的需要；及
- 減少交通對環境造成的影響。
